در سی امین نشست وزیران امرخارجه سازمان کنفرانس اسلامی در تهران از ۱۶۹ قطعنامه صادر شده ، باردیگر مساله قره باغ نیز مورد توجه قرارگرفت و با تصویب قطعنامه ای اشغال اراضی جمهوری آذربایجان محکوم شد . در این قطعنامه با حمایت از تمامیت ارضی جمهوری آذربایجان بر خروج نیروهای اشغالگر تاکید شده است . عبدالواحد بالقزیز دبیرکل سازمان کنفرانس اسلامی نیز از کشورهای اسلامی خواسته است تا برای حل و فصل مناقشه قره باغ و پایان دادن به اشغال این منطقه تلاش کنند . این اولین بار نیست که سازمان کنفرانس اسلامی از موضع جمهوری آذربایجان در مناقشه قره باغ حمایت می کند . واقعیت این است که اغلب ۵۷ عضو سازمان کنفرانس اسلامی پیش از با انتشار قطعنامه هایی اشغال بخشی از اراضی آذربایجان و نیز تخریب آثار اسلامی و تاریخی را در اراضی اشغالی محکوم کرده اند که جدیدترین نمونه های اجلاس وزیران امورخارجه در کوالالامپور در سال گذشته و اجلاس اخیر تهران بود .
حمایت کشورهای اسلامی از موضع جمهوری آذربایجان از چند بعد دارای اهمیت است . بویژه اینکه از سال ۱۹۹۹ به پیشنهاد سازمان امنیت و همکاری اروپا تمامیت ارضی جمهوری آذربایجان در مجمع عمومی سازمان ملل به رای گیری گذاشته می شود ، در این رای گیریها که تاکنون چهار بار انجام شده است ، اغلب قریب به اتفاق کشورهای عضو ناتو ، اتحادیه اروپا ، شورای اروپا و سازمان امنیت و همکاری اروپا رای ممتنع به تمامیت ارضی جمهوری آذربایجان داده اند . این تنها کشورهای اسلامی بوده است که از تمامیت ارضی جمهوری آذربایجان حمایت کرده اند و بنوعی مانع پیشبرد سیاست ارامنه جهت توجیه حقوقی و جهانی اشغال قره باغ شده اند . با وجو د این مناسبات باکو و سازمان کتفرانس اسلامی تاکنون چندان همسو با خواست افکار عمومی این کشور نبوده است . بطوریکه در نشست وزیران خارجه سازمان کنفرانس اسلامی ، ولایت قلی اف وزیر امورخارجه این کشور شرکت نکرد و ریاست هیات آذری را المان آراسلی سفیر جمهوری آذربایجان د ر عربستان جنوبی بعهده داشت . وزیر امورخارجه جمهوری آذربایجان بهنگام برگزاری این نشست در سفر رسمی و سه روزه رومانی بود، کشوری که بارها به تمامیت ارضی جمهوری آذربایجان رای ممتنع داده است . قلی اف پس از بازگشت از این سفر با اشاره به موضع سازمان کنفرانس اسلامی تاکید کرد که که حمایت این سازمان از جمهوری آذربایجان چندان اهمیتی ندارد . بی شک این موضع گیری باعث خواهد شد که مناسبات برخی از اعضاء سازمان کنفرانس اسلامی با جمهوری آذربایجان بسردی بگرایید . پیش از این تمایل باکو به همکاری با رژیم صهیونیستی باعث شده که برخی از کشورهای اسلامی نظیر سوریه و لبنان رای ممتنع به تمامیت ارضی جمهوری آذربایجان بدهند ، چرا که از نظر آن مناسبات یک کشور اسلامی مورد تجاوز قرار گرفته نظیر جمهوری آذربایجان با متجاوزی نظیر رژیم صهیونیستی توجیه منطقی ندارد .
آنچه مسلم است اینکه حمایت کشورهای اسلامی از جمهوری آذربایجان تنها مانع اجرای طرحهای ناعادلانه در قره باغ تاکنون بوده است . این حمایت ها تاکنون تنها سیاسی نبوده است . بلکه نهادهایی نظیر بانک توسعه اسلامی و کمیته پیگیری همکاریی اقتصادی شازمان کنفرانس اسلامی موسوم به کمسک تاکنون میلیونها دلار در اختیار جمهوری آذرباتیجان قرار داده اند .