با جدی شدن روند عادی سازی مناسبات ترکیه و ارمنستان، و همزمان با افزایش اعتراضات ج. آذربایجان به این رویکرد جدید دولت آنکارا، برخی احزاب مهم ترکیه نیز از این رویکرد انتقاد کردند. دنیز بایکال رهبر حزب جمهوریخواه خلق و بزرگترین حزب لائیک در نشست حزبی ، تحرکات دولت رجب طیب اردوغان نخست وزیر ترکیه برای بازگشایی مرز با ارمنستان را مشروعیت بخشیدن به اشغال قره باغ ، به مخاطره انداختن طرح نابوکو و تیره کردن روابط دوستانه با ج. آذربایجان ارزیابی کرد. بایکال بمنظور بی اساس نشان دادن اظهارات اخیر اردوغان مبنی بر اینکه مرز ترکیه و ارمنستان تا زمان حل مناقشه قره باغ بازگشایی نخواهد شد،به سخنان اخیر رییس جمهور آمریکا در پارلمان ترکیه که گفته بود اقدام های مهم آنکارا درباره ارمنستان را پی می گیریم؛ اشاره کرد.از نظر رهبر حزب جمهوریخواه خلق این اظهارات نشانه قول و قرارها پشت پرده بین ارمنستان و ترکیه است. اوباما در جریان سفر به ترکیه گفته بود که بر ادامه گفتگوی مقامات ترکیه و ارمنستان تاکید دارد و این گفتگوها می تواند بزودی نتایجی مهمی داشته باشد. احتمالا منظور وی از نتایج مهم بازگشایی رسمی مرز ترکیه و ارمنستان در آینده نزدیک است. رهبر حزب جمهوریخواه خلق ترکیه اعلام کرده است، بزودی در این خصوص به جمهوری آذربایجان سفر خواهد کرد . پیش از این حزب حرکت ملی یکی دیگر از احزاب مهم ترکیه نیز از رویکرد جدید دولت اردوغان در قبال ارمنستان انتقاد کرده بود. ترکیه که بر سر مسایل تاریخی متعددی از جمله مساله کشتار ۱۹۱۵ ارامنه با ارمنستان اختلاف دارد، طی سالهای گذشته مدعی شده است که بخاطر حمایت از ج. آذربایجان در مناقشه قره باغ، با ارمنستان روابط برقرار نکرده و از این طریق امتیازات فراوانی از باکو بویژه در حوزه انرژی اخذ کرده است. اما اکنون در شرایطی که ج. آذربایجان در موقعیت نامطلوبی در مذاکرات قره باغ قرار دارد و از سوی گروه مینسک برای پذیرش طرحی ناعادلانه تحت فشار است، آنکارا گامهای جدی برای عادی سازی مناسبات با ارمنستان برداشته است که یکی از آنها بازگشایی اعلام نشده و غیر رسمی بخشی از مرز است . طبیعی است که چنین اقدامی خشم گسترده مقامات و احزاب ج. آذربایجان را بدنبال داشته باشد. اما اعتراض های مقامات حزبی ترکیه از جمله بایکال بخاطر دلسوزی برای تمامیت ارضی و منافع ملی ج. آذربایجان نیست، بلکه این اعتراض ها از یک سو ناشی از اهداف حزبی و تبلیغاتی آنها در برابر حزب حاکم عدالت و توسعه و از سوی دیگر نیز ناشی از نگرانی آنها از تبعات منفی بازگشایی مرز ترکیه و ارمنستان بر منافع ملی ترکیه است. ترکیه در راستای استراتژی خود برای تبدیل شدن به چهارراه ترانزیت انرژی بدنبال ایفای نقش محوری در طرح انتقال گاز حوزه خزر به اروپا موسوم به نابوکو است.با توجه به هشدار باکو به تجدید نظر در روابط با ترکیه ، محافل سیاسی آنکارا نگرانند که در صورت بازگشایی مرز این کشور با ارمنستان، ج. آذربایجان در همکاریهای انرژی با ترکیه بویژه درزمینه طرح نابوکو تجدید نظر کند. بویژه اینکه روسیه مذاکرات آشکار و پنهانی با مقامات ج. آذربایجان بمنظور خرید گاز این کشور آغاز کرده است. سفر اخیر رئیس جمهوری آذربایجان به مسکو و گفتگوها و توافقات دو کشور در زمینه نفت و گاز هر چه بیشتر محافل سیاسی آنکارا را نگران کرده است.
گذشته از این موضوع، ترکیه در شرایطی گامهای جدی برای عادی سازی مناسبات با ایروان برداشته که پارلمان ارمنستان همچنان از شناسایی قرارداد ۱۹۲۱ قارص که مرز کنونی ترکیه و ارمنستان را مشخص کرده، خودداری می کند. در بیانیه استقلال ارمنستان نیز از مناطق جنوب شرق ترکیه به عنوان ارمنستان غربی نام برده شده است. ضمن اینکه از کوههای آغری که در ترکیه قرار دارند ، در ارمنستان به عنوان آرارات بزرگ و کوچک نام برده می شوند و از تصویر آنها به عنوان آرم دولتی ارمنستان استفاده می شود. برخی از محافل سیاسی ترکیه معتقدند قبل از بازگشایی مرز دو کشور، ارمنستان باید با پیشنهاد تشکیل یک کمیته مشترک متشکل از مورخین دو کشور برای بررسی حوادث ۱۹۱۵ موافقت کند، موضوعی که تاکنون ایروان با آن مخالفت کرده است. با توجه به همین موضوعات است که احزاب مهم ترکیه با عادی سازی مناسبات با ارمنستان مخالفند و معتقدند این روند نه موضوعی در چارچوب منافع ترکیه بلکه براساس خواسته امریکا و برخی از کشورهای غربی نظیر فرانسه که لابی ارامنه در آنها نفوذ دارند، انجام می شود.